第二集中，丁儀在空間站開展粒子對撞實驗，冒著系統(tǒng)超載爆炸的風險孤注一擲，以希望打破智子封鎖。但實驗最終宣告失敗，人類科學宣告死亡。這段緊張刺激的劇情讓觀眾們直觀感受到智子對人類科學的扼殺，也領略到了丁儀等科學家為了人類未來而拼盡一切的犧牲精神。

網(wǎng)友們紛紛在彈幕上刷出好評：“人類的贊歌就是勇氣的贊歌?！薄按敫泻軓姡謾C已經(jīng)炸了?！薄皽剀疤崾荆耗憧梢院粑！?

“原著黨表示滿意。增加的丁儀實驗這一段原著劇情屬實把我踹進儀吹大坑。”

然而，當《三體》動畫對原著大刀闊斧地改編，以符合影視藝術規(guī)律時，也必然會面臨另外一些問題。

在開頭“古箏行動”大場面先聲奪人之后，卻只用幾行字幕草草交代了故事背景和前情提要。沒看過原著小說的觀眾一頭霧水，他們很難理解“古箏行動”到底是在干什么、ETO是什么組織，更無法理解史強、汪淼、伊文斯和葉文潔這幾個關鍵人物的行為動機。

還有第二集中出現(xiàn)的一場與主線劇情關系不大、為了沖突而沖突的追車逃殺戲碼。

主角羅輯遭ETO組織余孽刺殺，史強護送羅輯在川流不息的公路上花式飆車，躲避追殺，期間甚至還出現(xiàn)了地鐵脫軌，從高架橋上砸下的夸張場面，畫面刺激程度堪比好萊塢爆米花電影《速度與激情》。

在原著小說的劇情設定中，ETO刺殺羅輯是要盡可能地偽裝成意外，防止地球政府發(fā)現(xiàn)他的重要性，絕對不可能像動畫劇情中這樣大張旗鼓地追殺。

藝畫開天主創(chuàng)團隊似乎為了追求沖突刺激的爽感，將《三體》動畫變成了正邪對立、英雄拯救世界的好萊塢爽片，原著的冷峻思辨、對人類文明的反思和恢弘壯闊的宇宙觀等深刻內(nèi)涵并沒有得到充分體現(xiàn)。

這種缺憾還體現(xiàn)在《三體》動畫的人物塑造上。

歷經(jīng)人生苦難，對人性和人類文明絕望，卻知書達理、充滿涵養(yǎng)，“跟中國無數(shù)普通老人沒有什么不同”的葉文潔，被改編成一個一臉殘酷冷漠、聲音嘶啞暗沉的臉譜化反派。

外表粗狂，心思縝密，直覺敏銳，提出“古箏行動”計劃，充滿人格魅力的史強，在動畫中卻成為一個人物弧光扁平的保鏢式人物。

最令粉絲難以接受的，是《三體》動畫對羅輯這一角色的改編。

原著中的羅輯是一個性格超脫的人，玩世不恭、及時行樂的面具下有著超越常人的智慧和冷靜。

而動畫中的羅輯卻聒噪輕佻，前腳情人剛身亡，后腳就能上躥下跳，給大史遞煙點火；在PDC總部被宣布為“面壁者”，羅輯全程沒有展現(xiàn)出高級學者應該有的智商和風度，甚至還上演了大庭廣眾下失態(tài)無措、丟徽章、摔話筒等夸張戲碼。

有觀眾直言：“這種性格根本就成不了‘面壁者’羅輯?！?

一些原著粉也無法接受《三體》動畫的劇情改編，紛紛給出差評：“挺好的，就是跟劉慈欣小說重名了?！薄叭w人看了都得集體脫水?！薄霸詾閯∏橐呀?jīng)到谷底了，沒想到你們學會了打洞?！?

值得注意的是，就在劇情引發(fā)爭議之際，《三體》動畫的編劇署名權問題也在網(wǎng)絡引發(fā)爭議。

知名編劇李亞玲12月15日發(fā)布微博聲討藝畫開天，稱編劇顧奕才是《三體》動畫的真正編劇，但卻在最終播出時被排在了第八位署名（一共十位），而所謂的總編劇卻是藝畫開天公司安排的“空降兵”，一個月內(nèi)匆匆改了一稿就掠奪了編劇的成果。

觀察者網(wǎng)查詢發(fā)現(xiàn)，《三體》動畫的總編劇總共有三位，分別是阮瑞、趙佳星和紀敬，其中阮瑞是藝畫開天的創(chuàng)始人兼CEO，紀敬是版權方三體宇宙的內(nèi)容負責人，而趙佳星則被報道稱擔任過藝畫開天另一部動畫《靈籠》的編劇，但《靈籠》的編劇署名欄中并沒有出現(xiàn)她的名字。