11月14日、16日，印軍在邊界全線再次發(fā)動(dòng)進(jìn)攻。11月16日，中國(guó)西藏、新疆邊防部隊(duì)奉命進(jìn)行第二階段自衛(wèi)反擊作戰(zhàn)。

為了打好第二階段反擊戰(zhàn)役，羅瑞卿將他修改了十余處的《此次反擊戰(zhàn)役中要切實(shí)注意的幾個(gè)問題》指示稿送賀龍、聶榮臻審閱后即發(fā)往西藏軍區(qū)前指，指示指出：這一仗打勝了，打好了，印方有可能仍然不愿談判，甚至采取更加極端的措施，表面上情況更加惡化，但在實(shí)際上還是好事，無(wú)非是再斗一個(gè)時(shí)期，最終還是會(huì)解決的，這是一方面。指示還指出：另一方面，也有可能逼使印方接受談判的建議，從此使這一方在一定時(shí)期內(nèi)安定下來(lái)，如果這一仗后即出現(xiàn)此種情況，殲滅敵人越多，則出現(xiàn)此種情況的可能越大，則對(duì)于我們會(huì)是更加有利的。

指示扼要分析了第二階段反擊戰(zhàn)役的意義后，再次諄諄告誡邊防部隊(duì)不可輕敵，要準(zhǔn)備打硬仗和準(zhǔn)備出現(xiàn)各種復(fù)雜困難的情況，指出：山地作戰(zhàn)，特別是就達(dá)旺河以南地區(qū)或瓦弄地區(qū)的具體地形看，我們固然要力爭(zhēng)各部隊(duì)之間聯(lián)絡(luò)好，協(xié)同好，但也要準(zhǔn)備相反的情況出現(xiàn)。因此每一個(gè)部隊(duì)，每一個(gè)團(tuán)、營(yíng)、連、排、班、小組甚至個(gè)人，都要準(zhǔn)備獨(dú)立作戰(zhàn)，都要有孤膽精神。避免打懵懂仗，但要打過硬仗。不管出現(xiàn)什么險(xiǎn)惡情況，例如就一段時(shí)間說(shuō)，或就某一個(gè)戰(zhàn)斗地形說(shuō)，敵人是多數(shù)，我們是少數(shù)，而且暫時(shí)同主力失去聯(lián)系，或者我某些部隊(duì)，攻堅(jiān)受挫，傷亡較大，等等，但是，只要沉著、堅(jiān)持，就一定會(huì)奪得戰(zhàn)斗的最終勝利。

第二階段自衛(wèi)反擊作戰(zhàn)，仍分東西兩段進(jìn)行。東段作戰(zhàn)主要是反擊西山口――邦迪拉地區(qū)和瓦弄地區(qū)兩個(gè)方向的入侵印軍。至21日，西藏邊防部隊(duì)殲滅和擊潰了大量入侵印軍，拔除了印軍據(jù)點(diǎn)，收復(fù)了被印軍侵占的領(lǐng)土，進(jìn)至金古底，逼近了傳統(tǒng)習(xí)慣線。此時(shí)印軍已無(wú)險(xiǎn)可守，中國(guó)邊防部隊(duì)處于有利態(tài)勢(shì)。與此同時(shí)，西段的新疆邊防部隊(duì)至20日將侵入班公洛地區(qū)的印軍全部清除。至此，中國(guó)邊防部隊(duì)已在東段和西段粉碎了印軍的全線進(jìn)攻。

11月20日18時(shí)，中國(guó)政府做出了關(guān)于中國(guó)邊防部隊(duì)全線停火后撤的決定，并于11月21日向全世界莊重聲明，宣布：1962年11月22日零時(shí)起，中國(guó)邊防部隊(duì)在中印邊境全線主動(dòng)?；?。從12月1日起，中國(guó)邊防部隊(duì)將從1959年11月7日中印雙方的實(shí)際控制線后撤20公里。

為了維護(hù)中印兩國(guó)政府和人民的傳統(tǒng)友誼，毛澤東在做出?；鸷蟪返臎Q策的同時(shí)，要求將在反擊戰(zhàn)中繳獲的武器、車輛進(jìn)行擦洗維修，其他物資進(jìn)行整理包裝，發(fā)還給印度。羅瑞卿堅(jiān)決執(zhí)行了古今中外戰(zhàn)爭(zhēng)史上從未有過的這一決策。當(dāng)時(shí)，邊防部隊(duì)有些干部建議把幾部性能較好的山地汽車留下。羅瑞卿得悉后指示：不要留，全部發(fā)還。1962年12月中旬，所有繳獲的武器、車輛及其他軍用物資均開列清單，交還印度。對(duì)被俘人員，中方一律不殺、不打、不罵、不侮辱，生活上給予優(yōu)待，受傷者給予治療，還組織他們?nèi)ヒ恍┲鞘?、工廠參觀。至1963年5月26日已將他們?nèi)酷尫呕貒?guó)。

在歷時(shí)一個(gè)月的中印邊界自衛(wèi)反擊作戰(zhàn)中，羅瑞卿作為總參謀長(zhǎng)，把黨中央、中央軍委和毛澤東的指示融會(huì)到經(jīng)過他親自起草或精心修改的一封封電報(bào)中，貫徹到反擊作戰(zhàn)的每一個(gè)重要軍事行動(dòng)之中。為此，他盡職盡責(zé)，夜以繼日，嘔心瀝血。前線的每一個(gè)行動(dòng)，戰(zhàn)況的每一點(diǎn)變化，都時(shí)時(shí)牽動(dòng)著他的心。而前線的每一點(diǎn)進(jìn)展，戰(zhàn)役的每一次勝利和成功無(wú)不蘊(yùn)含著他的心血。

1963年2月中旬，西藏軍區(qū)司令員張國(guó)華到北京向中央軍委匯報(bào)中印邊界自衛(wèi)反擊作戰(zhàn)的情況。當(dāng)羅瑞卿問張國(guó)華“這次打仗，有沒有什么問題”時(shí)，張國(guó)華說(shuō)：“總的當(dāng)然很好，但也不是沒有問題，并不是每一個(gè)團(tuán)，每一個(gè)營(yíng)，每一個(gè)連、排都打得好，也不是每一個(gè)指揮員都指揮得好。有的小分隊(duì)，甚至有的團(tuán)就出了一些問題。但是，當(dāng)時(shí)對(duì)部隊(duì)威脅最大的問題是輕敵。我到過許多連隊(duì)，問到干部、戰(zhàn)士：印軍有什么特點(diǎn)？都是異口同聲地回答：沒有什么了不起，一會(huì)跑，二會(huì)裝死。部隊(duì)普遍的說(shuō)法就是這個(gè)。一句話：輕視敵人。在兩次反擊作戰(zhàn)開始的時(shí)候，軍委都曾經(jīng)專門給我們打過電報(bào)，讓我們不要輕敵。第一仗打響以前，軍委指出，這一仗關(guān)系到軍威國(guó)威，要求我們只準(zhǔn)打好，不準(zhǔn)打壞。第二仗，軍委又來(lái)電報(bào)說(shuō)，千萬(wàn)不可輕敵驕傲，驕傲就會(huì)犯大錯(cuò)誤。軍委這兩個(gè)電報(bào)，對(duì)于兩次反擊作戰(zhàn)的勝利，起了很大作用！前一個(gè)給了我們極大的鼓舞，后一個(gè)給我們敲了警鐘，防止了部隊(duì)可能產(chǎn)生的輕敵麻痹情緒?！比缜八f(shuō)，前一個(gè)電報(bào)是羅瑞卿親自起草，后一個(gè)電報(bào)則經(jīng)他精心修改達(dá)10余處。