目前，新冠病毒已致我國(guó)數(shù)萬(wàn)人感染，上千人喪生，并蔓延至全球20多個(gè)國(guó)家。確認(rèn)中間宿主對(duì)阻止病毒的進(jìn)一步傳播至關(guān)重要。

此前，研究人員先后提出蝙蝠或是新冠病毒自然宿主，蛇、穿山甲可能是潛在中間宿主。

2月26日，湖北醫(yī)藥學(xué)院附屬人民醫(yī)院的劉龍聯(lián)合廣州暨南大學(xué)吳建國(guó)課題組在《醫(yī)學(xué)病毒學(xué)雜志》上發(fā)表論文稱，龜類（西部錦龜、綠海龜、中華鱉）也可能是將新冠病毒傳播給人類的潛在中間宿主。

最新研究采用冠狀病毒刺突蛋白和宿主ACE2受體的組成和差異，預(yù)測(cè)SARS-CoV-2的潛在中間宿主。

該研究的重點(diǎn)是比較SARS CoV-2與SARS-CoV、蝙蝠SARS樣CoV和其他冠狀病毒之間的刺突序列。這有助于進(jìn)行進(jìn)化分析，并尋找可能的病毒庫(kù)。此外，對(duì)ACE2結(jié)構(gòu)和結(jié)合基序比對(duì)的分析，有助于提供線索來(lái)區(qū)分潛在宿主。

SARS-CoV-2編碼至少27種蛋白質(zhì)，包括15種非結(jié)構(gòu)蛋白、4種結(jié)構(gòu)蛋白和8種輔助蛋白。刺突蛋白（S）是一種結(jié)構(gòu)蛋白，位于病毒體的外殼上，負(fù)責(zé)與宿主受體血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2（ACE2）結(jié)合。研究刺突蛋白中受體結(jié)合區(qū)域（RBD）序列的進(jìn)化關(guān)系有助于理解病毒起源趨勢(shì)。

研究結(jié)果表明，蝙蝠SARS樣CoV RaTG13與SARS-CoV-2整體基因組具有96.2%的序列同一性。值得注意的是，SARS-CoV是穿山甲標(biāo)本中分布最廣的冠狀病毒。

刺突RBD受體相互作用是決定冠狀病毒宿主范圍的關(guān)鍵因素。研究組對(duì)來(lái)自SARS-CoV、蝙蝠或穿山甲SARS樣CoV和SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD序列進(jìn)行了比對(duì)。

蝙蝠SARS樣CoV從第473到第490個(gè)殘基缺失，位于外部亞結(jié)構(gòu)域，似乎可以確定這些病毒不會(huì)自然感染人。目前并沒(méi)有直接證據(jù)表明，蝙蝠SARS樣CoV曾感染人類。

穿山甲SARS樣CoV SRR10168377與蝙蝠SARS樣CoV RaTG13僅具有85%的同一性。這表明如果只關(guān)注刺突RBD，穿山甲SARS樣CoV SRR10168377有可能越過(guò)宿主屏障感染人類。

類似SARS-CoV與人ACE2的結(jié)合，受體上的31、41、82、353、355和357位殘基在與SARS CoV-2刺突蛋白相互作用時(shí)會(huì)定位到表面。

從具有ACE2受體41和353位的RBD域中的Asn501來(lái)看，龜類和穿山甲似乎比蝙蝠更接近人類。這表明龜類和穿山甲可能是SARS-CoV-2的潛在擴(kuò)展宿主。

了解結(jié)構(gòu)結(jié)合機(jī)制將有助于找到準(zhǔn)確的病毒庫(kù)，并有助于制定預(yù)防對(duì)策。通過(guò)冷凍電子顯微鏡緊急分析SARS-CoV-2刺突蛋白的結(jié)晶體，有助于驗(yàn)證SARS CoV-2刺突RBD與人類ACE2或其他宿主受體之間相互作用的結(jié)合點(diǎn)。

據(jù)報(bào)道，SARS-CoV-2 刺突蛋白與ACE2的結(jié)合能力比SARS-CoV強(qiáng)得多。這表明SARS-CoV-2的中間宿主更多。

目前已知龜類作為病毒庫(kù)，攜帶數(shù)十種病毒，包括虹蛙病毒（RV）、尼多病毒（NV）、乳頭瘤病毒（PV）、甲魚虹彩病毒（STIV）、甲魚系統(tǒng)性敗血癥球狀病毒（STSSSV）、龜細(xì)小核糖核酸病毒（ToPV）和中華鱉出血綜合征病毒（TSHSV）。不能排除蝙蝠SARS樣CoV RaTG13或其他SARS樣CoV感染龜類，并在進(jìn)化后向人傳播。

從SARS-CoV和MERS-CoV到SARS-CoV-2，蝙蝠均是冠狀病毒的天然宿主，但中間宿主卻各不相同。此前研究表明，與其他動(dòng)物相比，蛇因其同義密碼子相對(duì)使用度（RSCU）偏向，很有可能是SARS-CoV-2的野生動(dòng)物病毒庫(kù)。

果子貍和單峰駱駝作為人畜共患病SARS-CoV和MERS-CoV的中間宿主，生活在不同的時(shí)空環(huán)境，但它們?nèi)詫⒐跔畈《緜鞑ソo人類。這使得短期內(nèi)找到SARS-CoV-2的中間宿主很難。

病毒受體結(jié)合序列和宿主受體的分析有助于快速靶向SARS-CoV-2可能的中間宿主。與非法交易的穿山甲相比，市場(chǎng)上的龜類更普遍受歡迎。

總之，該研究提供了一些信息，即與蛇和穿山甲一樣，龜類（西部錦龜、綠海龜、中華鱉）亦可能是將SARS-CoV-2傳播給人類的潛在中間宿主，但仍需進(jìn)一步研究來(lái)確認(rèn)。

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1.蛇

1月22日，北京大學(xué)團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)新型冠狀病毒與蛇具有相似的密碼子使用偏倚，推斷蛇可能是潛在中間宿主。

2.蝙蝠

2月3日，中科院武漢病毒所石正麗團(tuán)隊(duì)在Nature發(fā)表的論文顯示，中華菊頭蝠最有可能是新冠病毒的自然宿主。

3.穿山甲

2月6日，華南農(nóng)業(yè)大學(xué)團(tuán)隊(duì)研究表明，穿山甲為新型冠狀病毒潛在中間宿主。

2月20日，香港大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院教授管軼在穿山甲樣本中發(fā)現(xiàn)了冠狀病毒，再次表明穿山甲應(yīng)被視為新型冠狀病毒的可能中間宿主。