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湖南20例新冠病毒標(biāo)本測序均為德爾塔毒株，與南京疫情高度同源
最后更新: 2021-08-02 13:26:16記者今日獲悉，自7月28日拿到我省2021年第一例本土新冠肺炎病例標(biāo)本以來，湖南省疾控中心已完成20例德爾塔新冠病毒基因組測序。已經(jīng)完成測序結(jié)果的標(biāo)本均為德爾塔毒株，與南京高度同源。
5天時間已完成20例標(biāo)本測序
據(jù)省疾控中心檢驗科科長湛志飛介紹，基因組測序可在第一時間獲取新發(fā)未知病毒的基因組序列信息，已成為研究疾病暴發(fā)的重要工具。通過構(gòu)建進化樹，研究不同患者病毒遺傳序列變化，能在分子生物學(xué)層面揭示病毒的傳播方式，分析新冠病毒的進化來源，研究新冠病毒的致病病理機制，為控制疫情暴發(fā)提供科學(xué)依據(jù)。
通過檢測新冠病毒的全基因組序列，再將這個序列通過算法與數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)進行比對，可以初步判斷其地域來源。將序列與既往病例序列進行比對，如果序列在同一進化樹分支上，則可以判斷這些病例是否來自同一傳播鏈或傳染源。
面對此次疫情，從7月28日拿到湖南省2021年第一例本土新冠肺炎病例標(biāo)本以來，湖南省疾控已完成20例標(biāo)本測序。
24小時完成病毒基因測序溯源
“新冠病毒樣本送到實驗室后，一般需要經(jīng)過多個步驟完成檢測?！闭恐撅w稱，在接到陽性樣本后，工作人員首先進行復(fù)核工作，對樣本進行核酸提取，再用兩種試劑進行核酸檢測。復(fù)核陽性的標(biāo)本，分別用二代和三代高通量測序技術(shù)進行序列測定，為病毒溯源工作設(shè)置“雙保險”，確保萬無一失。
病毒基因序列測定完成后，工作人員還要馬上進行生物信息學(xué)分析，將病毒序列與數(shù)據(jù)庫中的序列進行比對，查看有無變異位點，進行同源性比較。完成數(shù)據(jù)比對后，還要及時撰寫溯源報告。
“目前，湖南省疾控中心已具備新冠病毒基因組高通量二代和三代測序能力，為湖南省新型冠狀病毒疫情以及其他傳染病病原體的鑒定和溯源、防控應(yīng)對提供了強大的技術(shù)支撐?！闭恐撅w介紹，去年10月份才掌握這項技術(shù)，以前都是送到國家疾控中心檢測。目前湖南省疾控中心培養(yǎng)了3名技術(shù)骨干，所有的新冠病毒基因組測序都能在24小時內(nèi)完成，情況復(fù)雜的也不會超過48小時。根據(jù)疫情的變化，只要有標(biāo)本來，都會在24小時內(nèi)啟動測序流程。
測序結(jié)果與南京高度同源
7月28日，接到2021年第一例本土新冠肺炎病例標(biāo)本測序工作以來，省疾控中心立即組織專業(yè)技術(shù)人員，日夜不停地開展測序工作，通過文庫制備、簇生成、上機測序與數(shù)據(jù)比對分析，已經(jīng)完成測序結(jié)果的標(biāo)本均為德爾塔毒株。從國家疾控中心反饋的結(jié)果顯示，和江蘇省報送的南京疫情本土病例新冠病毒基因組序列高度同源。
根據(jù)最新疫情通報，2021年7月20日0時至8月1日24時，湖南省累計報告新型冠狀病毒肺炎確診病例22例。此次疫情病原體為德爾塔變異株，范圍廣、來勢猛，廣大民眾一定不能掉以輕心，嚴(yán)格執(zhí)行好持碼進出、測量體溫、佩戴口罩、保持距離等措施，有效降低病毒傳播風(fēng)險，減少不必要的人員聚集。
- 原標(biāo)題：湖南省：新冠病毒標(biāo)本測序結(jié)果與南京高度同源
- 責(zé)任編輯: 于文凱
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